Hola Angélica,
Sí puedes borrar los archivos .log que nos indicas con tamaño 0
No borres los archivos JPA que corresponden a la copia de seguridad ni los restantes ya que el módulo podría dejar de funcionar.
En cualquier caso puedes hacer un comprimido de todos los archivos y descargarlo a tu ordenador. De esta forma tendrás la copia en el ordenador a mano por lo que pudiera pasar.
Te será útil ->
Saludos