Mover clon a dominio principal o apuntar dominio a carpeta clon (tenemos varias webs en una cuenta)  

Hola,
Antes que nada, les informo que también he puesto la consulta en el foro y he leído varios post sobre el tema. De todos, modos les agradecería si pudieran realizar ustedes esto por nosotros ya que no lo tenemos claro y con lo que nos ha costado hacer el clon no quisieramos arriesgarnos a problemas por hacer mal este proceso. Al tener varías webs en una cuenta y que los archivos .httacces son ahora distintos de lo que encontramos en el tutorial, nos da miedo hacerlo nosotros.

Consideraciones previas:
a) Tenemos 3 webs en una misma cuenta. Una de ellas (acudam.com) está en la raíz de public_html , mientras que las otras dos webs (cortinaestor y agriprotector) y el clon (clonnou) están en carpetas dentro de public_html (Adjunto pantallazo)
O sea:
public_html---> acudam.com (Web "vieja" 2.5 ahora en producción)
|
--> Carpeta 1 (Clon de acudam "Web acudam.com actualizada a Joomla 3") En directorio temporal
--> Carpeta agriprotector.com (Web agriprotector.com)
--> Carpeta cortinaestor (Web cortinaestor.es)

b)En mi caso lo que deseo es pasar el clon a producción y conservar la web "vieja" unos días en alguna carpeta.

Por otro lado, Stephan arroja este error:

[15-Dec-2017 10:11:35 Europe/Berlin] PHP Fatal error: require_once(): Failed opening required '/home/acudamco/public_html/cortinaestor/libraries/joomla/document/html/renderer/head.php' (include_path='.:/opt/alt/php56/usr/share/pear:/opt/alt/php56/usr/share/php') in /home/acudamco/public_html/cortinaestor/templates/epimeteo/error.php on line 79

Saludos y gracias
Joan