Hola,
Esto ocurre porque la imagen que estás subiendo ya tiene ese fondo blanco, es decir, el fondo forma parte de la imagen. Tendrías que editar la imagen con algún editor como Gimp, PhotoShop, etc. y quitarle el fondo. Luego, tendrías que guardarla en un formato diferente a jpg, ya que el formato jpg no admite transparencias. Lo recomendable sería que guardaras la imagen en un png.
De todas formas, veo que con el color de fondo de la plantilla que has elegido es posible que el logo no se vea bien si le quitas el fondo, ya que tanto el fondo como el logo utilizan colores oscuros.