Hola,
Simplemente tendrás que editar en la ficha del producto el campo ¿Gestionar el stock? que marcas en la captura de pantalla. Verás que al hacer esto se mostrará debajo un nuevo campo donde podrás introducir el stock disponible para ese producto.
Luego, cuando se vayan haciendo compras de este producto el stock irá bajando de forma automática.