Hola Sergio,
Verifica que tengas seleccionada la moneda correcta en Tienda => Vendedor => Moneda => Chilean Peso, por ultimo puedes verificar la configuración de la moneda en Configuracion => monedas => Chilean Peso
Para configurar los impuestos puedes revisar el siguiente vídeo tutorial:
Virtuemart 2.0: gestión de impuestos
http://www.videosjoomla.com/videos-joomla/item/519-virtuemart-20-gesti%C3%B3n-de-impuestos
Saludos.